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实验小白必看|重组蛋白表达系统怎么选?一篇讲清楚

发表时间:2025-12-30 访问次数:10

刚开始做重组蛋白表达时,很多人都会卡在同一个问题上:
“我这个蛋白,到底该用什么表达系统?”

大肠杆菌、酵母、昆虫细胞、哺乳动物细胞……

看起来选项很多,但真正让人困惑的不是“有什么”,而是:

为什么同一个基因,换个系统表达,结果会天差地别?

其实原因很简单,不同表达系统,能“照顾”蛋白的能力完全不一样。

一、先建立一个核心认知

不同表达系统的本质差异,并不只是“用的细胞不一样/把蛋白做出来”,而在于:能不能把蛋白做“对”

所谓“对”,至少包括以下几点:

· 能否正确折叠

· 是否具备必要的翻译后修饰

· 是否保持天然的生物学活性

这些能力,并不是所有系统都具备的。

二、主流表达系统详解

1. 很多人最先接触的大肠杆菌表达系统,本质上是一种高效但“不太会照顾蛋白”的原核系统。它的优势非常直观:生长速度快、操作简单、培养成本低,而且通常可以获得很高的表达量。正因为如此,它非常适合原核来源、结构相对简单、对翻译后修饰没有依赖的蛋白。

但问题也往往出现在这里。大肠杆菌缺乏真核细胞的折叠辅助体系和翻译后修饰能力,当它被用来表达真核蛋白,尤其是表达量被强行拉高时,很容易出现蛋白错误折叠、形成包涵体的情况。实验中常见的现象是:WB条带很好看,但蛋白几乎没有活性,甚至根本不溶。这并不是操作失误,而是系统能力本身的限制。

2. 当目标蛋白开始“对折叠有要求”时,酵母表达系统往往会被视为一种升级方案。酵母属于初级真核系统,已经具备二硫键形成和简单糖基化能力,同时仍然保持了培养成本相对较低、生长速度较快的特点。因此,对于一些需要基础修饰、但对糖基化精细结构要求不高的蛋白,酵母确实是一个性价比不错的选择。

需要注意的是,酵母的糖基化模式与哺乳动物细胞存在本质差异。它产生的多为高甘露糖型糖链,在某些情况下会影响蛋白的稳定性、体内半衰期,甚至直接影响生物学功能。因此,酵母系统“能不能用”,往往不是取决于蛋白能否表达出来,而是取决于下游实验是否允许这种修饰差异。

3.如果项目既希望提高成功率,又暂时无法承担哺乳动物细胞的成本,昆虫细胞–杆状病毒表达系统往往是一个非常稳妥的选择。这一系统在蛋白折叠、可溶性以及翻译后修饰方面,已经非常接近哺乳动物细胞,尤其适合分泌蛋白、结构复杂蛋白或膜蛋白的胞外结构域。

在实际科研中,很多在大肠杆菌中反复失败的蛋白,换到昆虫细胞后往往可以“被救回来”。当然,相应的代价是培养周期更长、成本更高,也需要更规范的实验条件。但从整体成功率来看,它是科研项目中非常常见、也非常可靠的一种真核表达方案。

4.当蛋白的功能高度依赖其天然构象和精确修饰时,选择空间其实并不大。哺乳动物细胞表达系统之所以被认为是“金标准”,是因为它能最大程度复现蛋白在人体内的真实状态。无论是复杂的N-连接糖基化,还是蛋白间相互作用所需的精细构象,这些都是其他系统难以完全替代的。

因此,在表达治疗性抗体、受体蛋白、关键细胞因子,或对生物学活性要求极高的蛋白时,哺乳动物细胞往往是不可回避的选择。与此同时,也必须接受它带来的现实成本:培养周期更长、操作要求更高、整体投入也更大

常见基因表达系统的区别(STAR Protoc. 2023 Oct 31;4(4):102572.)

三、小白实战技巧

对于刚入门的小白来说,面对一个全新的目标蛋白,可以先顺着一个简单但非常实用的思路来判断。如果蛋白来源于原核生物,且结构简单,大肠杆菌往往是最高效的起点;如果蛋白来源于真核生物,尤其是分泌蛋白或膜蛋白,就应尽早考虑真核表达系统。当蛋白分子量较大、含有多个二硫键,或者功能明显依赖糖基化时,原核系统的风险就会迅速放大。

从经验角度总结一句话:低成本、高产量、结构简单的蛋白可以优先尝试大肠杆菌;需要基础修饰、但对糖型不敏感的蛋白可以考虑酵母;结构复杂、希望提高成功率的科研项目适合昆虫细胞;而当蛋白功能和天然状态不可妥协时,哺乳动物细胞几乎是唯一合理的选择

新手如何选择合适的基因表达系统(STAR Protoc. 2023 Oct 31;4(4):102572.)

希望这篇文章能帮刚入门的你,在选择表达系统时少走一些弯路。真正的经验,往往来自一次次试错和总结,但如果能在一开始就选对方向,实验之路会轻松很多。


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